Штаммы вируса энцефалита из Восточной Сибири оказались похожи на европейские
Геномы сравнили иркутские и казанские учёные
Исследователи научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека из Иркутска и Казанского федерального университета впервые провели сравнительный анализ геномов штаммов вируса клещевого энцефалита европейского субтипа, выделенных у больных людей в Восточной Сибири и Европе. В результате исследования, имеющего важное значение для понимания природы вируса и его географического распространения, доказано генетическое сходство штаммов и выявлены потенциальные детерминанты вирулентности изолятов. Научная работа опубликована в журнале «Acta Biomedica Scientifica».
Расширение ареала, увеличение уровня заболеваемости, рост числа европейских стран, в которых регистрируются случаи клещевого энцефалита, а также появившаяся информация о летальных случаях заболевания, ассоциированных с европейским субтипом вируса, привлекает всё больше внимание учёных к этому варианту вируса.
- Для нас был интересны вопросы, насколько штаммы, изолированные в далёких друг от друга точках ареала (Европа и Восточная Сибирь), отличаются друг от друга и какие потенциальные детерминанты вирулентности присутствуют в их геномах. Полученные нами результаты подтверждают генетическую близость сибирских и европейских изолятов ВКЭ-ЕС, что имеет важное значение для лучшего понимания молекулярных основ патогенности вируса, эволюции вируса и его распространения на территории Евразии, — прокомментировал ведущий автор исследования, руководитель лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики НЦ ПЗСРЧ доктор медицинских наук Ирина Козлова.
Европейский подтип вируса клещевого энцефалита (ВКЭ-Евр) является одним из трёх основных подтипов наряду с сибирским (ВКЭ-Сиб) и дальневосточным (ВКЭ-ДВ). ВКЭ-Евр доминирует в Европе, тогда как ВКЭ-Сиб и ВКЭ-ДВ чаще встречаются в Азии. Однако существуют территории, где одновременно встречаются два или даже три основных субтипа вируса, а также два предполагаемых субтипа ВКЭ: Байкальский (ВКЭ-Байк) и Гималайский (ВКЭ-Гим). Одной из таких территорий является Восточная Сибирь, где обнаружены все известные на сегодняшний день субтипы ВКЭ, за исключением гималайского.
В своём исследовании учёные проанализировали все имеющиеся полногеномные последовательности штаммов ВКЭ-Евр, выделенные от больных людей и депонированные в международной базе данных «GenBank» на момент начала исследований в 2021 году. В работу были включены штаммы, изолированные на территории бывшего СССР, Чешской Республики, Словении и Финляндии в период с 1953 по 2015 годы.
Специалисты доказали, что уровень различий штаммов ВКЭ-Евр из разных географических регионов не превышает установленный ранее максимальный показатель в 3,1 % для данного субтипа.
- От Иркутской области в исследовании было представлено три штамма ВЕЭ-Евр, в том числе штамм 1G-98 из коллекции НЦ ПЗСРЧ. В ходе исследований учёные обнаружили, что этот штамм обладает высокими показателями церебральной и периферической активности для лабораторных животных. У него выявлена мутация, которая потенциально может быть ассоциирована с вирулентностью. Кроме того, в геноме обнаружена протяжённая делеция в вариабельной части 3'-некодирующей области, сопоставимая по длине с высоковирулентным Hypr из Европы, - сообщили в научном центре проблем здоровья семьи и репродукции человека.
Клещевой энцефалит по-прежнему остаётся одной из наиболее значимых природно-очаговых вирусных инфекций, передающихся через укусы иксодовых клещей. Нозоареал заболевания охватывает не только большую часть территории России, но и 29 стран Европы, а также ряд азиатских государств. Полученные результаты открывают новые перспективы в изучении патогенеза клещевого энцефалита и могут быть использованы при разработке более эффективных методов диагностики и профилактики заболевания.